मिरची पिकांंमध्ये तंबाखू अळी, मावा, तुडतुडे, कोळी, हरभरा अळी इत्यादी वेगवेगळ्या प्रकारचे रस शोषक किड्यांचा मोठ्या प्रमाणात आक्रमण होतो.
या कीटकांबरोबरच काही बुरशीजन्य रोग देखील मिरची पिकांवर मोठ्या प्रमाणात परिणाम करतात, जसे की, बॅक्टेरिया पानांवरील डाग, मूळकूज, स्टेम रॉट, अल्टेनेरिया पानांचे डाग, इत्यादी मिरची पिकांच्या आजारामुळे मोठ्या प्रमाणात हानी होते.